原創(chuàng) 王宇歌 博士 Hanson臨床科研

關(guān)鍵詞：新型冠狀病毒；起源；解讀

新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）的起源和傳播一直是人們最關(guān)心的問題。

復(fù)旦大學(xué)張永振等在Cell上發(fā)表了Commentary，概述了新冠病毒的病毒基因組研究起源，這與Andersen剛剛發(fā)表的Nature Med文章互補(bǔ)，為病毒傳播繪制了一個(gè)比較完整的藍(lán)圖。

我們的專欄科學(xué)家王宇歌博士第一時(shí)間解讀了這項(xiàng)研究。

作者從趨同進(jìn)化-跨種傳播-隱匿傳播等作出了解釋。

趨同進(jìn)化

目前公認(rèn)因?yàn)闊o癥狀傳播和發(fā)病前傳播的特性使SARS-CoV-2的傳染性極強(qiáng)。

由于華南海鮮市場的動(dòng)物樣本已無法取樣，現(xiàn)在也無法獲知最早的COVID-19感染者（0號病人），因此無法明確SARS-CoV-2最終形成是由于動(dòng)物跨種直接傳播引起，還是隱性人傳人引起。

目前報(bào)道的第一例COVID-19患者是2019年12月26日在武漢中心醫(yī)院收治入院的病人。張永振等1月5日獲得了該病人的病毒基因組序列，并將序列上傳到了GenBank（MN908947），并于1月11日上傳到了Virological。

截止目前已經(jīng)有超過200個(gè)SARS-CoV-2的基因組序列。由于病毒序列信息，研究人員進(jìn)一步將其序列與其他病毒比對，發(fā)現(xiàn)這一病毒屬于SARS-CoV家族，與SARS-CoV本身有79%同源性。因此SARS-CoV-2被歸入beta冠狀病毒。

而與SARS-CoV-2相似度最高的病毒是在云南發(fā)現(xiàn)的RaTG13，序列同源性高達(dá)96%。但SARS-CoV-2與RaTG13序列最顯著的差異是S蛋白的S1和S2亞基交界處的多堿基Furin蛋白酶切割位點(diǎn)（殘基PRRA），這一切PRRA還見于冠狀病毒HCoV-HKU1；SARS-CoV-2與RaTG13序列另一個(gè)不同是在RBD結(jié)合ACE2的6個(gè)關(guān)鍵氨基酸中，只有1個(gè)相同。

而本綜述中，作者又提出了另一個(gè)重要信息，在S1/S2切割位點(diǎn)有另一個(gè)十分特殊的PAA氨基酸序列，這一PAA序列見于2019年從云南的蝙蝠樣品中發(fā)現(xiàn)的另一株冠狀病毒RmYN02，但RmYN02僅與SARS-CoV-2有72%序列同源性。

跨種傳播

SARS-CoV-2起源于蝙蝠目前有大量證據(jù)支持，但是從蝙蝠到人的傳播鏈還不清晰。

比如RaTG13和RmYN02都在云南發(fā)現(xiàn)，距離武漢有1500公里，而從RaTG13進(jìn)化到SARS-CoV-2需要25-65年。這使得科學(xué)家猜想中間宿主所扮演的角色。SARS-CoV和MERS-CoV從蝙蝠到人，分別由果子貍和駱駝充當(dāng)了中間宿主；而華南農(nóng)業(yè)大學(xué)論文證明了穿山甲冠狀病毒的RBD與SARS-CoV-2具有97%氨基酸序列同源性，這一發(fā)現(xiàn)完善了SARS-CoV-2跨種傳播鏈的假說，但它也啟發(fā)科學(xué)家可能在野生哺乳動(dòng)物中有大量和多樣的冠狀病毒尚未被發(fā)現(xiàn)。

管軼的研究，填上了新冠病毒來源拼圖中的最關(guān)鍵一片。

隱秘傳播

除了跨種傳播，另一種具有最大可能性的傳播是SARS-CoV-2在完成跨種后可能在人與人之間形成了隱秘傳播（Cryptic Transmission）。從Bedford的序列分析中可見端倪。這一理論可能可以解釋為何武漢流行的主要為“L型” 。

但病毒突變形成Furin蛋白酶切割位點(diǎn)是病毒在動(dòng)物中間宿主中形成，還是在人中隱秘傳播中突變形成，目前沒有明確答案。這同樣也提示應(yīng)該持續(xù)監(jiān)測病毒突變，尤其在現(xiàn)在大范圍傳播的情況下，應(yīng)該持續(xù)關(guān)注引起表現(xiàn)型變化的病毒突變。

而回溯追蹤2019年12月之前醫(yī)院患者的樣本或許可以獲得隱秘傳播的信息。

但是COVID-19疫情提示動(dòng)物病毒跨種傳播危害之大、可傳播范圍之廣，因此在疫情之后應(yīng)出臺(tái)相應(yīng)政策措施杜絕野生動(dòng)物的販?zhǔn)邸?/p>

祝愿朋友們和家人都平平安安。

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Hanson解讀由在美國工作的醫(yī)生和醫(yī)學(xué)科學(xué)家組成，通過對經(jīng)典研究論文的解讀和專家直接撰寫的述評，傳遞醫(yī)學(xué)進(jìn)展信息；在探索及激發(fā)新的研究方向的同時(shí)，解析科研設(shè)計(jì)及論文撰寫規(guī)范。

成員主要包括：王宇歌博士，一直從事病毒新藥研發(fā)；金沖飛醫(yī)生，美國執(zhí)業(yè)醫(yī)師；朱永紅博士，從事病毒研究，目前主要做新藥研發(fā)；謝琰臣博士，一直從事免疫病臨床科研和新藥研發(fā)。另外，特別感謝美國執(zhí)業(yè)醫(yī)師Gloria醫(yī)生的友情支持和我們的編輯部。

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編輯：Henry；