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華山醫(yī)院感染科回顧19天疑似病例診斷:如何快速和準(zhǔn)確診斷

艾靜文、張昊澄、喻一奇
2020-02-18 00:08
澎湃商學(xué)院 >
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編者按:

近日,新型冠狀病毒肺炎疫情舉世矚目,社交媒體上的信息轟炸牽動著全國人民的心。為幫助大家了解疫情的動態(tài)變化,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科微信公眾號“華山感染”特別邀請張文宏、王新宇等專家就疫情的變化趨勢、熱點問題及相關(guān)注意事項,專門進行答疑解讀。

自新冠肺炎疫情發(fā)生以來,華山醫(yī)院感染科專家一直跟蹤,已在“華山感染”連續(xù)撰文,他們的文字既專業(yè)嚴(yán)謹(jǐn)又通俗易懂,澎湃新聞經(jīng)授權(quán)轉(zhuǎn)發(fā)。我們希望“華山感染”的這一組文章,對讀者更理性地看待疫情、更有效地做好自我防護工作有所裨益。

引言

2019年12月,新型冠狀病毒肺炎在湖北省武漢市爆發(fā),隨后疫情迅速蔓延至全國,至今我國各個省份均有病例報道。節(jié)后返工潮來臨,各大城市都需要構(gòu)建既不影響經(jīng)濟又能有效防控的新冠病毒病新型防控體系。

縱觀武漢早期疾病擴散,和后期全國各地疾病得到較好控制的其中一個重要經(jīng)驗就是:發(fā)現(xiàn)病人到入院隔離,以及相關(guān)接觸人群的篩查是否及時和疫情息息相關(guān)。根據(jù)武漢最早的數(shù)據(jù),從發(fā)現(xiàn)癥狀到住院是12天左右,所以疾病出現(xiàn)了廣泛的傳播。而現(xiàn)在,無論武漢還是武漢外城市,這個時間都縮短到了1-2天。所以我們對武漢乃至湖北地區(qū)接下去的防控也有著充分的信心。

武漢外的城市,則必須延續(xù)早期的快速反應(yīng)策略。其中重中之重的核心和關(guān)鍵,仍是快速和準(zhǔn)確診斷患者。

為了早期明確目前現(xiàn)行的診斷流程的應(yīng)用價值及可能潛在的不足之處,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科近期通過牽頭多中心研究回顧了2020年1月22日至2020年2月9日新冠疑似患者的診斷及結(jié)果,提出了湖北外地區(qū)優(yōu)化診斷方法和流程的一些建議,給湖北外的疫情防控提交了一份華山答卷。相關(guān)內(nèi)容提前發(fā)表在MedRxiv網(wǎng)站上和全球分享,并在此和國內(nèi)醫(yī)療團隊分享。

王辰院士既往訪談中曾表示,對于新型冠狀病毒SARS-CoV-2陽性的患者,核酸檢測仍存在假陰性的風(fēng)險。

通過華山醫(yī)院感染科啟動的多中心的綜合性醫(yī)院發(fā)熱門診的研究提示,在中國東部上海地區(qū),冬季肺炎(包括新冠肺炎)的臨床癥狀以及前期CT表現(xiàn)十分類似。我們頭對頭對53名疑似新冠肺炎患者的鼻咽拭子標(biāo)本進行核酸RT-PCR以及二代測序(mNGS)檢測,并進行常見病原體多重PCR檢測(涵蓋甲乙流,RSV,支原體,鼻病毒等常見病原體)。最終共有20位患者確診為新冠肺炎,20名患者mNGS均檢測到SARS-CoV-2,14名患者首次RT-PCR陽性;3名患者首次RT-PCR陰性(假陰性率約15%),隔日采樣復(fù)測PCR陽性;3位患者持續(xù)PCR陰性。

該項研究中的SARS-CoV-2均進行了RT-PCR及宏基因組學(xué)檢測,結(jié)果提示目前對于新冠肺炎患者,鼻咽拭子連續(xù)兩次PCR檢測存在約15%的假陰性率,這可能與研究中標(biāo)本采集的方法、標(biāo)本采集的部位、試劑盒的穩(wěn)定性、實驗操作多個因素相關(guān)。目前上呼吸道標(biāo)本檢出病毒能否真實反應(yīng)下呼吸道感染尚有爭論,但基于篩查的簡便性、易操作性等原因,目前常用鼻咽拭子等標(biāo)本進行篩查檢測。臨床中,對于新型冠狀病毒肺炎,除了可靠的有創(chuàng)的支氣管肺泡灌洗液采集,其他標(biāo)本選擇包括口咽拭子、鼻咽吸取物、痰液等。但在本研究中,能咳出深部痰液的患者比例較少,因此臨床也需衡量各個標(biāo)本的可及性及采集過程的安全性。

而對于目前新型冠狀病毒RT-PCR常用的靶標(biāo),包括orf1ab, E基因,S基因等,N基因等,也仍需要更多的臨床研究,來探討更優(yōu)的RT-PCR 靶標(biāo)選擇。

在本次研究中,62.26%的不明原因肺炎患者最終被診斷為非新型冠狀病毒感染者,這也提示,在湖北以外地區(qū)的臨床診斷中,仍需對其他病原體保持警惕,完善檢查。此外在這20名新冠肺炎的患者中,我們發(fā)現(xiàn)11名(共感染率為55%)患者存在共感染現(xiàn)象,涵蓋病毒(H3N2,乙流,RSV,鼻病毒),細菌(副流感嗜血桿菌、產(chǎn)氣克雷伯菌)和真菌(白色念珠菌)。提示在冬季肺炎好發(fā)時期,其他呼吸道病原體檢測陽性不能作為新冠肺炎的排除標(biāo)準(zhǔn)。

病原學(xué)分布

基于上述結(jié)論,我們提出,當(dāng)前湖北外地區(qū),新冠肺炎的診斷流程,應(yīng)結(jié)合流行病學(xué)史,臨床表現(xiàn),胸部CT,核酸檢測以及其他病原學(xué)檢測的方法對冬季不明原因肺炎患者進行綜合評估。對于嚴(yán)重懷疑新冠肺炎且PCR陰性的患者,首先應(yīng)進行復(fù)測。如果持續(xù)陰性應(yīng)進行其他類型呼吸道樣本采樣,特別是下呼吸道標(biāo)本(BALF)采樣;必要時根據(jù)各地需求,可以考慮送檢二代測序或第三方檢測以提高檢測陽性率。

優(yōu)化診斷流程

劃重點

這項研究成果的發(fā)表有助于優(yōu)化湖北外地區(qū)新冠病毒檢測流程,COVID-19是傳播性極強的一類傳染病。在湖北外地區(qū)病原學(xué)的快速、準(zhǔn)確檢測無疑對疾病的快速隔離、有效防控正是這個問題的解決方法,正如WHO秘書長Tedros Adhanom Ghebreyesus說的那樣,若無嚴(yán)格的防控,疫情似乎會蔓延成一片汪洋火海,但現(xiàn)在它仍是一簇火苗,一點火星。我們?nèi)杂邢M蜎Q心在其蔓延之前掐滅這一可能,而這正是快速和精確診斷能夠提供給我們的。

主要參考文獻:

Xinhua News. 《新聞1+1》:白巖松對話王辰院士.2020.2.5. http://www.chinanews.com/shipin/2020/02-05/news846924.shtml. 2020.2.5.

Zhu N, Zhang D, Wang W, et al. A Novel Coronavirus from Patients withPneumonia in China, 2019. N Engl J Med. 2020:10.1056/NEJMoa2001017.

WHO names deadly virus from China as ‘COVID-19’. In. https://guardian.ng/news/who-names-deadly-virus-from-china-as-covid-19/.

Wang C, Horby PW, Hayden FG, Gao GF. A novel coronavirus outbreak ofglobal health concern. Lancet. 2020:S0140-6736(0120)30185-30189.

(本文原題為《華山感染:防疫“救火隊”,臨床研究探索新冠肺炎診斷策略優(yōu)化》,作者艾靜文、張昊澄、喻一奇為華山醫(yī)院感染科醫(yī)生,審核:艾靜文、 張文宏,微信首發(fā)于公眾號“華山感染”,版權(quán)歸復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科所有,澎湃新聞獲授權(quán)轉(zhuǎn)發(fā)。)

    責(zé)任編輯:蔡軍劍
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