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基因編輯先驅杜德納給“基因魔剪”安“剎車”:避免傷及無辜

澎湃新聞記者 王盈穎
2017-08-29 13:38
來源:澎湃新聞
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受熱捧的基因編輯技術CRISPR-Cas9并非完美,它猶如一輛沒有剎車裝置的汽車,可能失控傷及無辜,即產生脫靶效應——編輯了不該編輯的基因片段。從去年12月開始,科學家們爭先恐后地開啟為CRISPR安上“剎車”的研究,他們試圖從自然界,找出這個“剎車”。

美國生物學家、最先提出CRISPR-Cas9可以進行基因編輯的詹妮弗·杜德納(Jennifer Doudna)也是其中的一員。當?shù)貢r間8月24日,她與同事的相關論文發(fā)表在頂級期刊《細胞》(Cell)雜志,揭示了兩個可以為CRISPR的基因編輯畫上停止鍵的蛋白質是如何發(fā)揮作用的。此外,這兩個抑制蛋白具有廣譜性,也就是說可以適用不同的CRISPR系統(tǒng)。

CRISPR系統(tǒng)應用于基因編輯,是科學家從細菌身上取得的“經(jīng)”。為了對付“殺手”噬菌體,細菌的免疫系統(tǒng)經(jīng)過漫長的時間,進化出CRISPR系統(tǒng)。一旦有噬菌體入侵細菌,細菌的免疫系統(tǒng)會抓取一段噬菌體的DNA作為備份。等到下一次噬菌體再次來襲,細菌就可以根據(jù)備份,做出識別。識別成功時,細菌的Cas9蛋白會切斷噬菌體的DNA。這套系統(tǒng)為人類所用時,可以高效地對目標基因進行切割、添入等編輯。由于其高效,在業(yè)界有“基因魔剪”之稱。

盡管CRISPR系統(tǒng)被廣泛驗證其有效性,成為全球各大生物實驗室的寵兒,也有一些人體臨床試驗已經(jīng)開展。但CRISPR的脫靶性問題尚未得到完全解決。一旦CRISPR系統(tǒng)進入工作模式,科學家們此前一直沒有辦法干預其過程,只能任其操作至自然結束,其中可能會發(fā)生錯誤編輯非目標基因的情況,帶來安全性隱患。

可喜的是,科學家們發(fā)現(xiàn),求生的本能同樣讓噬菌體想出對策,進化出了針對細菌CRISPR系統(tǒng)的抑制蛋白,用來逃避細菌免疫系統(tǒng)的攻擊。這些抑制蛋白被稱為ACR蛋白。

杜德納與同事此次研究的AcrIIC1 和AcrIIC3便是其中兩種。

AcrIIC1 和AcrIIC3是通過什么方式來對付難纏的CRISPR系統(tǒng)呢?杜德納和同事發(fā)現(xiàn),當AcrIIC1和Cas9蛋白相遇時,AcrIIC1會緊緊結合Cas9用來抓取DNA的位置,從而使得Cas9無法搗亂。打個比方,這相當于給Cas9這把鋒利的剪刀套上了外殼,無法再做出“剪”的行為。

不僅如此,AcrIIC1可以抑制多種Cas9蛋白,具有廣譜性。

相比之下,AcrIIC3能發(fā)揮作用的范圍要小,只能抑制一種Cas9蛋白。而且,和AcrIIC1不同,AcrIIC3不結合Cas9蛋白,而是將兩個Cas9蛋白拉攏在一起,改變它們的結構,從而使得Cas9對DNA無計可施。

值得一提的是,杜德納并不是第一個發(fā)現(xiàn) CRISPR系統(tǒng)“關閉開關”的人。

在2016年12月,來自加拿大多倫多大學和美國馬薩諸塞大學的科學家們首次發(fā)現(xiàn)了自然界隱藏的這類“關閉開關”。但當時,科學家們還不清楚,這些抑制蛋白是如何發(fā)揮“關閉開關”作用的。

數(shù)個月后,來自不同國家的兩個科研小組先后通過解析蛋白結構是什么樣的,來揭示抑制蛋白防守CRISPR系統(tǒng)的機制。其中就包括哈爾濱工業(yè)大學教授黃志偉的課題組。但他們所解析的和杜德納此次解析的都為不同種類的抑制蛋白。

不久的將來,科學家或許就能找到最合適的“關閉開關”,不由CRISPR系統(tǒng)任性,為其安全性“保駕護航”。

    校對:張艷
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