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法國(guó)檢測(cè)到新冠變異新毒株B.1.640.2,有46處突變
近日,來(lái)自法國(guó)的科學(xué)家報(bào)告新冠變異新毒株B.1.640.2,其擁有46處突變。目前在法國(guó)南部已有12人被檢測(cè)出感染了B.1.640.2變異毒株。
該研究成果刊發(fā)于醫(yī)學(xué)預(yù)印本網(wǎng)站medRxiv上,未經(jīng)同行評(píng)議。研究單位為法國(guó)馬賽地中海大學(xué)附屬醫(yī)院傳染病研究所(IHU),目前他們暫時(shí)將該變異毒株命名為IHU。由于目前病例數(shù)尚不明確,其傳播力、毒性、免疫逃逸能力也有待研究。
法國(guó)科學(xué)家的分析揭示了B.1.640.2擁有46個(gè)突變和37個(gè)缺失。其中,刺突蛋白(S蛋白)中有 14 個(gè)氨基酸置換,包括 N501Y 和 E484K,以及9個(gè)缺失。這種基因型模式讓其成為了B.1.640.2譜系,它是舊B.1.640譜系系統(tǒng)發(fā)育姐妹群。兩個(gè)譜系的不同之處在于25個(gè)核苷酸替換和33個(gè)缺失。
在刺突蛋白上同時(shí)含有N501Y和E484K突變之所以值得關(guān)注,因?yàn)榇掏坏鞍自谶M(jìn)入人類細(xì)胞中起到了關(guān)鍵作用:刺突蛋白能結(jié)合人類細(xì)胞的ACE2受體 ,也是mRNA疫苗制造的主要靶標(biāo)。此前研究表明,新冠病毒S蛋白若出現(xiàn)E484A或N501Y突變,提示免疫逃逸能力增強(qiáng)。 研究人員表示,他們最早在上普羅旺斯阿爾卑斯省??柣囊幻鹿诓《靖腥菊呱砩习l(fā)現(xiàn)了該變異毒株。該患者是從喀麥隆旅行后確診的,因此懷疑這一變異毒株可能源于非洲。
復(fù)旦大學(xué)病原微生物研究所所長(zhǎng)姜世勃此前接受澎湃新聞(www.nxos.com.cn)采訪時(shí)表示,新冠病毒作為一種RNA病毒,較易發(fā)生變異。
根據(jù)美國(guó)病毒學(xué)家、諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)得主David Baltimore提出的病毒分類,包括新冠病毒在內(nèi)的冠狀病毒屬于正鏈RNA病毒,也就是說(shuō)病毒的基因組RNA可以直接作為mRNA進(jìn)行病毒蛋白質(zhì)的翻譯合成,病毒基因組先合成出負(fù)鏈RNA,再以其為模板合成出子代的正鏈基因組RNA。
值得一提的是,病毒聚合酶(polymerase)在病毒基因組復(fù)制和轉(zhuǎn)錄中起核心作用,RNA病毒則利用RNA依賴性RNA聚合酶(RdRp)復(fù)制和轉(zhuǎn)錄其基因組。而RNA容易突變的原因即在于RdRp不具有核酸酶校對(duì)活性,因此其基因組在復(fù)制過(guò)程中核苷酸的錯(cuò)配率就比較高。
在前后兩任中科院武漢病毒研究所所長(zhǎng)胡志紅、陳新文主編的《普通病毒學(xué)》一書(shū)中,病毒的突變率通常定義為在病毒的每個(gè)復(fù)制周期中,病毒子代基因組中產(chǎn)生核苷酸突變的平均數(shù)。他們提到,與其他生物體相比較,病毒具有很高的突變率。一般來(lái)說(shuō),RNA病毒每10^3-10^7個(gè)核苷酸中就會(huì)出現(xiàn)一個(gè)錯(cuò)誤堿基,而DNA病毒突變率相對(duì)較低,沒(méi)10^9-10^10個(gè)核苷酸會(huì)發(fā)生一次這樣的錯(cuò)誤。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院和萬(wàn)科公共衛(wèi)生與健康學(xué)院張林琦教授此前在接受澎湃新聞(www.nxos.com.cn)記者采訪時(shí)表示,實(shí)際上,作為RNA(核糖核酸)病毒中的一種,人們對(duì)新冠病毒的突變無(wú)需感到驚訝,“它自己在復(fù)制過(guò)程中的復(fù)制機(jī)器就沒(méi)有像人類基因復(fù)制那么準(zhǔn)確,這是RNA病毒的一種‘天性’。”





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